Mas o salto de popularidade da obra de Takahasi aconteceu com as versões em anime. A primeira série de desenhos, Yu-Gi-Oh!, saiu em 1998, com 27 episódios, e não empolgou muito. Mas em 2000 veio Yu-Gi-Oh! Duel Monsters, que se transformou num sucesso mundial, com 224 episódios produzidos.
A partir daí, Takahasi esteve por trás de novas séries de mangás e animes, numa das franquias mais rentáveis da cultura pop japonesa recente.
Essa jornada é interrompida com sua morte, que pode ter sido provocada por um acidente enquanto ele mergulhava, uma prática regular do artista. Mas a polícia japonesa abriu uma investigação ampla, não descartando até a chance de um assassinato. Takahasi tinha 60 anos.
No Brasil, Yu-Gi-Oh! é publicado pela JBC, selo de mangás recentemente adquirido pela Companhia das Letras. Foram lançados pela JBC os 38 volumes originais da saga.